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湖南疾控已完成20例新冠病毒标本测序,均为德尔塔毒株,与南京高度同源

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分类:社会

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湖南日报·新湖南客户端8月2日讯 (记者 张春祥 通讯员 张亚娜 李世康) 记者今日获悉,自7月28日拿到我省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来,湖南省疾控中央已完成20例德尔塔新冠病毒基因组测序。已经完成测序效果的标本均为德尔塔毒株,与南京高度同源。

5天时间已完成20例标本测序

据省疾控中央磨练科科长湛志飞先容,基因组测序可在第一时间获取新发未知病毒的基因组序列信息,已成为研究疾病暴发的主要工具。通过构建进化树,研究差异患者病毒遗传序列转变,能在分子生物学层面展现病毒的流传方式,剖析新冠病毒的进化泉源,研究新冠病毒的致病病理机制,为控制疫情暴发提供科学依据。

通过检测新冠病毒的全基因组序列,再将这个序列通过算法与数据库中的数据举行比对,可以劈头判断其地域泉源。将序列与既往病例序列举行比对,若是序列在统一进化树分支上,则可以判断这些病例是否来自统一流传链或熏染源。

面临此次疫情,从7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来,湖南省疾控已完成20例标本测序。

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24小时完成病毒基因测序溯源

“新冠病毒样本送到实验室后,一样平常需要经由多个步骤完成检测。”湛志飞称,在接到阳性样本后,事情职员首先举行复核事情,对样本举行核酸提取,再用两种试剂举行核酸检测。复核阳性的标本,划分用二代和三代高通量测序手艺举行序列测定,为病毒溯源事情设置“双保险”,确保万无一失。

病毒基因序列测定完成后,事情职员还要马上举行生物信息学剖析,将病毒序列与数据库中的序列举行比对,查看有无变异位点,举行同源性对照。完成数据比对后,还要实时撰写溯源讲述。

“现在,湖南省疾控中央已具备新冠病毒基因组高通量二代和三代测序能力,为湖南省新型冠状病毒疫情以及其他熏染病病原体的判断和溯源、防控应对提供了壮大的手艺支持。”湛志飞先容,去年10月份才掌握这项手艺,以前都是送到国家疾控中央检测。现在湖南省疾控中央培育了3名手艺主干,所有的新冠病毒基因组测序都能在24小时内完成,情形庞大的也不会跨越48小时。凭证疫情的转变,只要有标原本,都市在24小时内启动测序流程。

测序效果与南京高度同源

7月28日,接到2021年第一例本土新冠肺炎病例标本测序事情以来,省疾控中央立刻组织专业手艺职员,日夜一直地开展测序事情,通过文库制备、簇天生、上机测序与数据比对剖析,已经完成测序效果的标本均为德尔塔毒株。从国家疾控中央反馈的效果显示,和江苏省报送的南京疫情本土病例新冠病毒基因组序列高度同源。

凭证最新疫情转达,2021年7月20日0时至8月1日24时,湖南省累计讲述新型冠状病毒肺炎确诊病例22例。此次疫情病原体为德尔塔变异株,局限广、来势猛,宽大民众一定不能掉以轻心,严酷执行好持码收支、丈量体温、佩带口罩、保持距离等措施,有用降低病毒流传风险,削减不需要的职员群集。

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